Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E8

PCDHB15, Protocadherin beta-15, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB15Q9Y5E8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHB15Q9Y5E8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB15Q9Y5E8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms