Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD3Q9Y597 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms