Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK45

LSM7, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM7Q9UK45 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM7Q9UK45 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms