Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC17A6Q9P2U8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms