Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC4BQ9NT99 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms