Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms