Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC29

NOD2, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD2Q9HC29 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOD2Q9HC29 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.6 ms