Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHACTR1Q9C0D0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms