Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC3Q9BY71 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.6 ms