Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW7

SCRT1, Transcriptional repressor scratch 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT1Q9BWW7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCRT1Q9BWW7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCRT1Q9BWW7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCRT1Q9BWW7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCRT1Q9BWW7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCRT1Q9BWW7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCRT1Q9BWW7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCRT1Q9BWW7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCRT1Q9BWW7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCRT1Q9BWW7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCRT1Q9BWW7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCRT1Q9BWW7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCRT1Q9BWW7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCRT1Q9BWW7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCRT1Q9BWW7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCRT1Q9BWW7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCRT1Q9BWW7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCRT1Q9BWW7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCRT1Q9BWW7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms