Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPAS2Q99743 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPAS2Q99743 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms