Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPNS2Q96L46 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPNS2Q96L46 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms