Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUBCNQ92622 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms