Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNE4Q8N205 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNE4Q8N205 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYNE4Q8N205 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms