Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHA9Q7RTU4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHA9Q7RTU4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms