Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP30Q70CQ3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms