Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRIP3Q6Q6R5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CRIP3Q6Q6R5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms