Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5W5

SLC39A4, Zinc transporter ZIP4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A4Q6P5W5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC39A4Q6P5W5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC39A4Q6P5W5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC39A4Q6P5W5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC39A4Q6P5W5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC39A4Q6P5W5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC39A4Q6P5W5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC39A4Q6P5W5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC39A4Q6P5W5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC39A4Q6P5W5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC39A4Q6P5W5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC39A4Q6P5W5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms