Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC36.16■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
EEA1Q15075 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC36.11■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC36.1■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
EEA1Q15075 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
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