Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPTAN1Q13813 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTAN1Q13813 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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