Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAF3Q13114 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TRAF3Q13114 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF3Q13114 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF3Q13114 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF3Q13114 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF3Q13114 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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TRAF3Q13114 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF3Q13114 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF3Q13114 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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TRAF3Q13114 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF3Q13114 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF3Q13114 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF3Q13114 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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TRAF3Q13114 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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TRAF3Q13114 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF3Q13114 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF3Q13114 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF3Q13114 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF3Q13114 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF3Q13114 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF3Q13114 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF3Q13114 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF3Q13114 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF3Q13114 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRAF3Q13114 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF3Q13114 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF3Q13114 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF3Q13114 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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