Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD8P48556 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms