Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
PHKA1P46020 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms