Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF2E1P29083 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF2E1P29083 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms