Protein–RNA interactions for Protein: P21771

MRPS28, 37S ribosomal protein S28, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 286 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPS28	P21771	CTR1	YPR124W	1221 nt		3.57	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	YBR219C	YBR219C	384 nt		3.57	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	YAK1	YJL141C	2424 nt		3.56	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	FLO10	YKR102W	3510 nt		3.56	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	GSH2	YOL049W	1476 nt		3.56	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	AI5_BETA	Q0075	1065 nt		3.56	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	YDR445C	YDR445C	408 nt		3.56	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	RRT7	YLL030C	342 nt		3.56	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	YLR049C	YLR049C	1287 nt		3.56	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	SEC2	YNL272C	2280 nt		3.56	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	EMC1	YCL045C	2283 nt		3.56	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	LAP2	YNL045W	2016 nt		3.56	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	KTR6	YPL053C	1341 nt		3.55	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	SPI1	YER150W	447 nt		3.55	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	CDC8	YJR057W	651 nt		3.55	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	YNL013C	YNL013C	378 nt		3.55	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	RER1	YCL001W	567 nt		3.55	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	RPN1	YHR027C	2982 nt		3.55	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	SEA4	YBL104C	3117 nt		3.55	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	USA1	YML029W	2517 nt		3.54	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	COX18	YGR062C	951 nt		3.54	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	RPS4B	YHR203C	786 nt		3.54	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	RPS4A	YJR145C	786 nt		3.54	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	YML116W-A	YML116W-A	303 nt		3.54	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	RHO5	YNL180C	996 nt		3.54	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	FRT2	YAL028W	1587 nt		3.54	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	PTM1	YKL039W	1572 nt		3.54	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	SIZ1	YDR409W	2715 nt		3.54	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	NOG1	YPL093W	1944 nt		3.54	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	GDH2	YDL215C	3279 nt		3.53	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	CLB4	YLR210W	1383 nt		3.53	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	SNT1	YCR033W	3681 nt		3.53	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	AAD3	YCR107W	1092 nt		3.53	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	PXR1	YGR280C	816 nt		3.53	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	ECM34	YHL043W	513 nt		3.53	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	YKT6	YKL196C	603 nt		3.53	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	NSE1	YLR007W	1011 nt		3.53	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	COQ5	YML110C	924 nt		3.53	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	YNL181W	YNL181W	1224 nt		3.53	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	YOL035C	YOL035C	303 nt		3.53	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	snR17a	snR17a	333 nt		3.53	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	DOA4	YDR069C	2781 nt		3.53	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	THR4	YCR053W	1545 nt		3.53	□□□□□ -1.84
MRPS28	P21771	FOX2	YKR009C	2703 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	AUS1	YOR011W	4185 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	RRP5	YMR229C	5190 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	ALR2	YFL050C	2577 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	PHO13	YDL236W	939 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	UBC1	YDR177W	648 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	PHM6	YDR281C	315 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	TRP4	YDR354W	1143 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	YGL082W	YGL082W	1146 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	YGL132W	YGL132W	336 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	LNP1	YHR192W	837 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	YIL163C	YIL163C	354 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	YBL010C	YBL010C	843 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	snR37	snR37	386 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	PTR3	YFR029W	2037 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	PFK26	YIL107C	2484 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	MEK1	YOR351C	1494 nt		3.52	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	YMR317W	YMR317W	3423 nt		3.51	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	RNA14	YMR061W	2034 nt		3.51	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	STB3	YDR169C	1542 nt		3.51	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	TAF10	YDR167W	621 nt		3.51	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	SNM1	YDR478W	597 nt		3.51	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	YGR011W	YGR011W	327 nt		3.51	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	RPL17A	YKL180W	555 nt		3.51	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	YLR122C	YLR122C	378 nt		3.51	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	FRM2	YCL026C-A	582 nt		3.51	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	SRS2	YJL092W	3525 nt		3.5	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	TGL3	YMR313C	1929 nt		3.5	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	MMR1	YLR190W	1476 nt		3.5	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	YDR246W-A	YDR246W-A	201 nt		3.5	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	STE14	YDR410C	720 nt		3.5	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	CAF16	YFL028C	870 nt		3.5	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	TVP18	YMR071C	504 nt		3.5	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	CDC45	YLR103C	1953 nt		3.5	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	NAM2	YLR382C	2685 nt		3.5	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	YPS7	YDR349C	1791 nt		3.5	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	CDC9	YDL164C	2268 nt		3.5	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	KIN2	YLR096W	3444 nt		3.5	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	PSY4	YBL046W	1326 nt		3.49	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	GAS5	YOL030W	1455 nt		3.49	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	SSE2	YBR169C	2082 nt		3.49	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	DAS2	YDR020C	699 nt		3.49	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	ENT5	YDR153C	1236 nt		3.49	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	BUD25	YER014C-A	462 nt		3.49	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	RPS1B	YML063W	768 nt		3.49	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	TFA1	YKL028W	1449 nt		3.49	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	FAR8	YMR029C	1572 nt		3.49	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	STV1	YMR054W	2673 nt		3.48	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	PMT6	YGR199W	2280 nt		3.48	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	tL(UAG)J	tL(UAG)J	82 nt		3.48	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	tL(UAG)L1	tL(UAG)L1	82 nt		3.48	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	tL(UAG)L2	tL(UAG)L2	82 nt		3.48	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	YGR291C	YGR291C	222 nt		3.48	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	SNF8	YPL002C	702 nt		3.48	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	YBR298C-A	YBR298C-A	222 nt		3.48	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	ROD1	YOR018W	2514 nt		3.48	□□□□□ -1.85
MRPS28	P21771	MDN1	YLR106C	14733 nt		3.48	□□□□□ -1.85

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