Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB6O95452 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB6O95452 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB6O95452 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB6O95452 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB6O95452 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB6O95452 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB6O95452 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB6O95452 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB6O95452 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB6O95452 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB6O95452 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB6O95452 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB6O95452 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB6O95452 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB6O95452 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB6O95452 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB6O95452 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB6O95452 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB6O95452 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB6O95452 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB6O95452 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB6O95452 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB6O95452 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB6O95452 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB6O95452 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB6O95452 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB6O95452 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB6O95452 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB6O95452 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB6O95452 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB6O95452 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB6O95452 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB6O95452 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB6O95452 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB6O95452 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB6O95452 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB6O95452 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB6O95452 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB6O95452 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB6O95452 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB6O95452 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB6O95452 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB6O95452 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB6O95452 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB6O95452 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB6O95452 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB6O95452 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB6O95452 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB6O95452 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB6O95452 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB6O95452 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB6O95452 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB6O95452 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB6O95452 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB6O95452 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB6O95452 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB6O95452 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB6O95452 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB6O95452 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB6O95452 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB6O95452 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB6O95452 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB6O95452 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB6O95452 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB6O95452 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB6O95452 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB6O95452 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB6O95452 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB6O95452 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB6O95452 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB6O95452 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB6O95452 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB6O95452 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB6O95452 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB6O95452 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB6O95452 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB6O95452 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB6O95452 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB6O95452 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB6O95452 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB6O95452 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB6O95452 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB6O95452 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB6O95452 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB6O95452 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB6O95452 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB6O95452 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB6O95452 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB6O95452 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB6O95452 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB6O95452 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB6O95452 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB6O95452 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB6O95452 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB6O95452 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB6O95452 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB6O95452 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB6O95452 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB6O95452 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms