Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCA5LO95447 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCA5LO95447 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCA5LO95447 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCA5LO95447 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCA5LO95447 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LCA5LO95447 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LCA5LO95447 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LCA5LO95447 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LCA5LO95447 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms