Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3KRW8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3KRW8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3KRW8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3KRW8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3KRW8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3KRW8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3KRW8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3KRW8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3KRW8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3KRW8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3KRW8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3KRW8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3KRW8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3KRW8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3KRW8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3KRW8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3KRW8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
J3KRW8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3KRW8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3KRW8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3KRW8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3KRW8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3KRW8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3KRW8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3KRW8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3KRW8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3KRW8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3KRW8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3KRW8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3KRW8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3KRW8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3KRW8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3KRW8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
J3KRW8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3KRW8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3KRW8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3KRW8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3KRW8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3KRW8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
J3KRW8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
J3KRW8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3KRW8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3KRW8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3KRW8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3KRW8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3KRW8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3KRW8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3KRW8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3KRW8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3KRW8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3KRW8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3KRW8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3KRW8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3KRW8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3KRW8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3KRW8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3KRW8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3KRW8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3KRW8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3KRW8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3KRW8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3KRW8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3KRW8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3KRW8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3KRW8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3KRW8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3KRW8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3KRW8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3KRW8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3KRW8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3KRW8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3KRW8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3KRW8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3KRW8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3KRW8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3KRW8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3KRW8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
J3KRW8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
J3KRW8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
J3KRW8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
J3KRW8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
J3KRW8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
J3KRW8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
J3KRW8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
J3KRW8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3KRW8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3KRW8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3KRW8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3KRW8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3KRW8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3KRW8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3KRW8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3KRW8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3KRW8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3KRW8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3KRW8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3KRW8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
J3KRW8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3KRW8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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