Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA6L9A6NEM1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms