Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO3A2RU48 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMCO3A2RU48 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms