Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y324

FCF1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCF1Q9Y324 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FCF1Q9Y324 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FCF1Q9Y324 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms