Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LEMD3Q9Y2U8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LEMD3Q9Y2U8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LEMD3Q9Y2U8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LEMD3Q9Y2U8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LEMD3Q9Y2U8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LEMD3Q9Y2U8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LEMD3Q9Y2U8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LEMD3Q9Y2U8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LEMD3Q9Y2U8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LEMD3Q9Y2U8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LEMD3Q9Y2U8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LEMD3Q9Y2U8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
LEMD3Q9Y2U8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LEMD3Q9Y2U8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LEMD3Q9Y2U8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LEMD3Q9Y2U8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LEMD3Q9Y2U8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LEMD3Q9Y2U8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LEMD3Q9Y2U8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LEMD3Q9Y2U8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LEMD3Q9Y2U8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LEMD3Q9Y2U8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LEMD3Q9Y2U8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LEMD3Q9Y2U8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LEMD3Q9Y2U8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
LEMD3Q9Y2U8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LEMD3Q9Y2U8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LEMD3Q9Y2U8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LEMD3Q9Y2U8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LEMD3Q9Y2U8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LEMD3Q9Y2U8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LEMD3Q9Y2U8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LEMD3Q9Y2U8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LEMD3Q9Y2U8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LEMD3Q9Y2U8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms