Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
VPREB3Q9UKI3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms