Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV5

RAPGEFL1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEFL1Q9UHV5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAPGEFL1Q9UHV5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAPGEFL1Q9UHV5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAPGEFL1Q9UHV5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAPGEFL1Q9UHV5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAPGEFL1Q9UHV5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAPGEFL1Q9UHV5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAPGEFL1Q9UHV5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPGEFL1Q9UHV5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RAPGEFL1Q9UHV5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEFL1Q9UHV5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEFL1Q9UHV5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEFL1Q9UHV5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEFL1Q9UHV5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEFL1Q9UHV5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEFL1Q9UHV5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEFL1Q9UHV5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEFL1Q9UHV5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEFL1Q9UHV5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEFL1Q9UHV5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEFL1Q9UHV5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEFL1Q9UHV5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEFL1Q9UHV5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEFL1Q9UHV5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEFL1Q9UHV5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEFL1Q9UHV5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms