Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
CDK12Q9NYV4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms