Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATAD3AQ9NVI7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 426.7 ms