Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0M0

WWP1, NEDD4-like E3 ubiquitin-protein ligase WWP1, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WWP1Q9H0M0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WWP1Q9H0M0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms