Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRC3Q9BY71 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC3Q9BY71 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms