Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP25Q9BV90 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms