Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBF4Q9BQW3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms