Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNTD1Q8N815 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTD1Q8N815 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms