Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP30Q70CQ3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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