Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC62Q6P9F0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms