Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LMOD2Q6P5Q4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
LMOD2Q6P5Q4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms