Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC30Q5VVM6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms