Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
FAM78BQ5VT40 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM78BQ5VT40 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms