Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTF1Q16619 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTF1Q16619 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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