Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC18A3Q16572 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC18A3Q16572 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
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