Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PTPRKQ15262 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PTPRKQ15262 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
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