Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFTN1Q14699 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
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